Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Utp20Q5XG71 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Utp20Q5XG71 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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