Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Specc1Q5SXY1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms