Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brip1Q5SXJ3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brip1Q5SXJ3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms