Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Med13Q5SWW4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Med13Q5SWW4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms