Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc42Q5SV66 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms