Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms