Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf215Q5SPX3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf215Q5SPX3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms