Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav8d-2Q5R1B6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms