Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms