Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm2Q5FW85 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms