Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkaa1Q5EG47 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkaa1Q5EG47 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms