Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nlrc3Q5DU56 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nlrc3Q5DU56 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nlrc3Q5DU56 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms