Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms