Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chsy3Q5DTK1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chsy3Q5DTK1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms