Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms