Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2bQ56A07 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms