Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrig2Q52KR2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms