Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rtl6Q505G4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rtl6Q505G4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl6Q505G4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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