Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx33Q4VAA7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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