Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lin28bQ45KJ6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lin28bQ45KJ6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Lin28bQ45KJ6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Lin28bQ45KJ6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Lin28bQ45KJ6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin28bQ45KJ6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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