Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pydc3Q3V3Q4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms