Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms