Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm44Q3V089 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm44Q3V089 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms