Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hipk4Q3V016 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms