Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C87499Q3UX49 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C87499Q3UX49 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms