Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Capn13Q3UW68 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Capn13Q3UW68 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms