Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms