Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b2Q3UJB0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms