Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm648Q3UJ22 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm648Q3UJ22 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm648Q3UJ22 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm648Q3UJ22 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm648Q3UJ22 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm648Q3UJ22 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm648Q3UJ22 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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