Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf44Q3UHJ8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf44Q3UHJ8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms