Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Puf60Q3UEB3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Puf60Q3UEB3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms