Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trafd1Q3UDK1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trafd1Q3UDK1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms