Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms