Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pid1Q3UBG2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pid1Q3UBG2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms