Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtpbp6Q3U6U5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms