Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U6N9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U6N9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U6N9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U6N9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms