Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk3Q3U3Q1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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