Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud5Q3U2S4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud5Q3U2S4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms