Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms