Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LcorlQ3U285 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms