Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Serac1Q3U213 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serac1Q3U213 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 377.9 ms