Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc174Q3U155 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms