Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hace1Q3U0D9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms