Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms