Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3TTJ4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms