Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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