Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdnep1Q3TP92 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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