Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms