Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2f1Q3THK3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms