Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms